山西中医学院是一所年轻的高等中医药院校，成立于1989年。1999年6月，学校通过了国家教育部组织的本科教学工作合格评估。2002年开始招收留学生。2004年，学校接收了原太原铁路中心医院和太原铁路结核病医院，并改建为山西中医学院中西医结合医院。2007年4月，学校以“良好”的成绩通过了教育部本科教学工作水平评估。2008年2月，学校获得了硕士单位授予权，2009年开始招收硕士研究生。学校现已成为山西省中医药教育、科研、医疗的中心。

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